Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms