Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AF067845.2-201ENST00000617093 3049 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PRAMEF7-201ENST00000330881 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PATJ-215ENST00000635137 2298 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BCDIN3D-201ENST00000333924 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FIRRE-201ENST00000427391 2926 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHGB6-201ENST00000520790 4599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 POLH-202ENST00000372236 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ELF3-203ENST00000367284 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KPRP-201ENST00000606109 2492 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF233-201ENST00000391958 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ASB15-201ENST00000275699 2706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NOX4-210ENST00000527956 2379 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ACSBG2-210ENST00000591403 2690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NECTIN4-201ENST00000368012 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms