Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LITAF-207ENST00000571459 677 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC118754.2-201ENST00000574133 537 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC129492.4-201ENST00000581248 465 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC005277.1-201ENST00000582915 335 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SLFN5-203ENST00000592325 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF528-210ENST00000594530 544 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC012594.1-214ENST00000630496 858 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 DRD1-201ENST00000393752 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FRMPD1-202ENST00000377765 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PLXNA4-204ENST00000423507 3314 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 KLHL15-201ENST00000328046 6272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC012651.1-204ENST00000495723 3881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 COG6-204ENST00000455146 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NELL2-204ENST00000437801 3279 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TKTL2-201ENST00000280605 2654 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC00243-201ENST00000399196 2052 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ARHGEF9-202ENST00000374870 4644 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PROM1-207ENST00000508167 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NRAP-202ENST00000360478 5426 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ERCC6-203ENST00000447839 3411 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 YIPF5-202ENST00000448443 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MRS2-204ENST00000443868 3980 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TRMT10A-201ENST00000273962 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 OCLN-201ENST00000355237 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ACTR8-201ENST00000335754 3629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC01854-201ENST00000375987 2213 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ACTBL2-201ENST00000423391 2794 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PCDHGC4-203ENST00000617094 2793 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 BCL2L13-201ENST00000317582 2992 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AMBRA1-211ENST00000533727 4817 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZFP57-203ENST00000488757 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CCDC69-201ENST00000355417 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RP1-201ENST00000220676 7100 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LCA5-203ENST00000467898 2894 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CPNE4-209ENST00000512055 5431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC01235-201ENST00000604724 2328 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 KIR3DX1-205ENST00000610811 3325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CCDC80-202ENST00000439685 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AP002761.1-201ENST00000400985 262 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MORF4L1P1-201ENST00000404582 967 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL627313.1-201ENST00000428860 238 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL441963.1-201ENST00000435137 792 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC02217-203ENST00000508677 296 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC016868.1-201ENST00000521725 523 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FAHD2P1-201ENST00000546381 939 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL049870.1-201ENST00000557196 308 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC005392.2-201ENST00000595748 301 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 EIF4BP4-201ENST00000441847 1780 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 DCAF13-205ENST00000521971 2049 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CEP44-204ENST00000457424 3290 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FAM69A-203ENST00000613902 2468 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF19-205ENST00000564230 2205 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC092279.1-202ENST00000597683 1966 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AP005060.1-201ENST00000623868 3174 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 KCNE1-209ENST00000621601 3148 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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