Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL154P-201ENST00000578043 324 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC103974.2-201ENST00000611319 778 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC241585.4-201ENST00000640951 686 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PACRG-202ENST00000366888 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ADH7-205ENST00000482593 1420 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 IPP-202ENST00000396478 3113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC007614.2-201ENST00000569877 1851 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL139811.2-201ENST00000373465 1630 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA71D-201ENST00000363484 134 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PHACTR1-204ENST00000379348 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP119-201ENST00000410753 273 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC084871.2-201ENST00000503355 464 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF345-205ENST00000526123 458 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms