Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA3Q9Y6H8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA3Q9Y6H8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms