Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAXBP1Q9Y5B6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms