Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP20Q9Y2K6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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