Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPCN1Q9ULQ1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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