Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO40Q9UH90 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO40Q9UH90 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms