Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XCL2Q9UBD3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms