Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCMF1Q9P0J7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms