Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms