Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPF2Q9HAU5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPF2Q9HAU5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms