Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMURF2Q9HAU4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms