Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX4Q9H1E5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms