Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MTMR12Q9C0I1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR12Q9C0I1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms