Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4CQ9C0C4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms