Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROPN1BQ9BZX4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms