Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms