Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms