Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNS3Q9BQ31 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms