Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP9Q99956 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms