Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3AQ99856 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms