Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TPD52L3Q96J77 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms