Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms