Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms