Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBOF1Q8ND07 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms