Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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