Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC117Q8IWD4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms