Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D4Q7Z3S7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms