Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms