Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED13LQ71F56 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms