Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms