Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C9orf47Q6ZRZ4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms