Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms