Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HP1BP3Q5SSJ5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HP1BP3Q5SSJ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms