Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms