Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms