Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD55Q3KP44 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD55Q3KP44 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms