Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms