Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6V1FQ16864 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms