Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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