Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHD4Q14839 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHD4Q14839 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
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