Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53BQ14153 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53BQ14153 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53BQ14153 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53BQ14153 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53BQ14153 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53BQ14153 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53BQ14153 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53BQ14153 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53BQ14153 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms