Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2H2Q13888 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H2Q13888 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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