Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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