Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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