Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms