Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms