Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ARID5AQ03989 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARID5AQ03989 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARID5AQ03989 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARID5AQ03989 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARID5AQ03989 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID5AQ03989 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms